基因扩增实验室又称PCR实验室，实验室原则上分为四个单独的工作区域，前两区为扩增前区，后两区为扩增后区。扩增前区与扩增后区应严格分开。实验材料、试剤、记录纸、等、清洁材料等，只能从扩增前区流向扩增后区，即从试剤准备区一样品处理区一扩增区一扩增产物分析区，不得逆向流动。
实验室的气流也应从扩增前区流向增后区，不得逆向流动。各工作区域应设置幾冲间，工作可与幾冲间之间直安装连锁装置。不同功能的核酸检验工作区应是分隔独立的工作室，并有明显的标志，各区间不能直通。各区之间如果是紧密相连，需安装物品传递窗。每个工作区域的顶部应安装紫外灯，外灯的波长为254nm，安装数量为每20m2安装一支40W的紫外灯。
实验室较为理想的布局模式为有一个专用走廊，试剂准备区、标本制备区、扩增区和产物分析区很规范地排列在一起，前三个区各有一个缓冲间，可供换工作服和工作鞋使用，顶上可装一紫外灯。内实验区域设为正压或常压状态，簧沖间内设为负压状态(可上设一抽风装置)，使这三个区的空气流向为由实验区域内向外，冲间内通向内实验室和走廊的门可安装一种连锁装置，当一个门打开时，另一]必须处于关闭状态，防止出现两个门同时打开的情況。产物分析区可不设冲间，但应设为负压状态(装一个排风扇即可)，使空气流向由外向内，以防止扩增产物的随空气流出。每一区域都须有明确的标记，工作按试剤准备区、标本制备区、扩増区至产物分析区单一流向进行，各区的仪器设备包括工作服、鞋、实验记录本和笔等都必须专用。
PCR扩增检验实验室原则上分为四个单独的工作区域：试剂贮存和准备区、标本制备区、扩增反应混合物配制和扩增区、扩增产物分析区。为避免交叉污染，进入各个工作区域必须严格遵循单一方向进行，即只能从试剂贮存和准备区→标本制备区→扩增反应混合物配制和扩增区→扩增产物分析区。
